Управляющий Совет муниципального автономного общеобразовательного учреждения прогимназии «Кристина» г. Томска является коллегиальным органом государственно-общественного управления Учреждения, призванный решать в первую очередь задачи стратегического управления: в каких направлениях развивать прогимназию, чтобы ее сделать успешной, как привлекать и расходовать школьные средства и др.
Совет Учреждения принимает участие в обсуждении и принятия решения по функционированию и выработке стратегических направлений развития прогимназии.